Performansa çar amûrên ampûlasyonê yên naskirî yên naskirina Sars-cov-2 li Etiyopyayê

Spas ji bo serdana xwezayê.com. Hûn bi piştgiriya CSS-a sînorkirî guhertoyek gerok bikar tînin. Ji bo ezmûna çêtirîn, em pêşniyar dikin ku hûn gerokek nûvekirî bikar bînin (an jî moda lihevhatinê li Internet Explorer) bikar bînin). Wekî din, da ku piştgiriya domdar piştrast bike, em malperê bêyî şêwaz û javascript destnîşan dikin.
Carouselek sê dirûşmeyan yekcar nîşan dide. Bişkojên berê û din bikar bînin da ku di yek carekê de bi sê dirûşmeyan bi rê ve bibin, an jî bişkokên dirûşm bikar bînin da ku di yek carekê de bi sê dirûşmeyan ve biçin.
Ji roja nexweşiya Coronavirus (Covid-19) derketinê, gelek ceribandinên amûrên amplîkî yên navokî (Naats) li seranserê cîhanê pêşve xistin û bûne sedema texmînên standard. Her çend gelek ceribandin zû hatin pêşxistin û li ser ceribandinên tespîtkirina laboratîf hatin pêşxistin, performansa van ceribandinan di mîhengên cûrbecûr de nehatine nirxandin. Ji ber vê yekê, ev lêkolîn bi armanca performansa SARBOTT SARS-COV-2, DAAN, BGI, û Sanserî Biotech bikar tîne ku bi karanîna standard (CRS) ya Reference Composite bikar tîne. Lêkolîn li Enstîtuya Tenduristiyê ya Giştî ya Etiyopî (EPHI) hate kirin. Ji 164 nimûneyan, 59.1% erênî bûn û 40.9% ji bo crs negatîf bûn. Sanserî Biyotech Positivity bi giranî li gorî crs (p <0.05) kêm bû. Sanserî Biyotech Positivity bi giranî li gorî crs (p <0.05) kêm bû. Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению С Crs (0 05). Encamên erênî yên Sanserî Biotech bi giranî li gorî crs (P <0.05) kêmtir bûn.与 crs 相比, Sansure biotech 的阳性率显着较低 (p <0.05).与 crs 相比, Sansure biotech 的阳性率显着较低 (p <0.05). У Sansure biotech было значительно знално положительных резильтот по сравнению с Crs (0 0,05). Banserî Biyotech bi giranî encamên erênî li gorî crs (p <0.05) kêmtir encamên erênî hebûn.Peymana giştî ya çar analîzên 96.3-100% li gorî crs. Digel vê yekê, rêjeya erênî ya kêm a Sansure Assay, performansa çar assayan hema hema lihevhatî bû. Wekî wusa, Sansure Biyotech [Tenê Lêkolîn (RUO)] Assay ji bo karanîna wê li Etiyopyayê pêdivî ye. Di paşiya paşîn de, divê lêkolînek zêde were hesibandin ku meriv bi îdiayên hilberînerê guncan re binirxîne.
Testkirina laboratorê beşek ji Rêxistina Tenduristiyê ya Cîhanê ye (Kî) Plana Stratejîk ji bo Nexweşiya Coronavirus 2019 (Covid-19) Amadekirin û Bersiv (SPRP). Kî şîret dike ku pêdivî ye ku ew welatan kapasîteya laboratîf ava bikin da ku amadebûn, rêvebirina dadperwer, hişmendî, hişmendî û bersivê bilez ji bo pirsgirêkên tenduristiya gelemperî baştir bikin. Ev pêşniyar dike ku rola laboratorê keyfek e ku meriv nexweşiyê û epidemiology of agents enfeksiyonên derketî û kontrolkirina belavbûna wan kontrol bike.
Diyariya Covid-19 hewce dike ku agahdariya epidemiolojîk û bijîjkî, nîşanên kesane / nîşanên kesane, û daneya radyografî û laborasyonê. Ji ber ku derketina Covîdê-19 li Wuhan, Chinaîn, gelek ceribandinên amplicasyona navokî ya bazirganî (NAATS) hate ragihandin. Reaksiyona Reverse Reverse Veguheztina Zincîra Zincîra Polymerase (RRT-PCR) wekî rêbazek birêkûpêk û standard ji bo tespîtkirina laboratorê ya Sindroma Respirasyonê ya giran 2 (Sars-cov-2) 3 enfeksiyonê hate bikar anîn. Dîtina Molekular a Sars-COV-2 bi gelemperî li ser bingeha N (NucleoNapsid Protein Gene, û RNLP (RNAL RNA POLYMERASE GENES) Genes / B (Frame RNADE 1A / B). Gene) Herêma ji Genoma Viral hate nasîn. Ew ji bo nasnameya vîrusê di genomên virusê de têne hesibandin Di nav van genim de, RDRP û Gen bi hişmendiya tespîtkirina analîtîkî ya bilind heye, dema ku N Gene xwedî hestiyariya analîtîkî ya kêm e.
Performansa Assayên PCR dikare bi faktorên cihêreng cûda cûda bibe Wekî Nîsana 2020-an, zêdetirî 48 amûrên tespîtkirina cûda ji neh welat destûrnameya karanîna acîl wergirtine destûrnameya karanîna acîl (EUA) ji bo tespîtkirina Covid-196. Li Etiyopyayê, zêdetirî 14 platformên PCR-ê ji bo tespîtkirina PCR-ê di 26 saziyên tenduristiyê yên giştî de, di nav de Abi 7500, Abbott M2000, Roche 48000 û hejmar-studio7 jî têne bikar anîn. Digel vê yekê, kîtabên testa PCR-ê hene, yên wekî ceribandina genimê ya DAAN, Testa Abbott Sars-Cov-2, testa Sansure Biotech, û testa Sars-COV-2 BGI. Her çend RRT-PCR pir hesas e, hin nexweşên bi Covid-19 re raporên neyînî yên derewîn ji ber kopên neçê yên acîdê ribonucleic a viral (RNA) di nimûneyan de ji ber berhevkirin, veguhastin, hilanîn û ceribandinên laboratorî. şert û çalakiyên personel8. Digel vê yekê, nimûne an kontrolkirina mishandling, cycle (ct) Bi vî rengî, eşkere ye ku ceribandinên PCR bi rastî karwanên parçeyên genim nas dikin, ji ber ku ew di heman demê de cûdahiyên bi rastî jî cudahiyê dikin, lewra ceribandinan tenê karwanan nas dikin10. Ji ber vê yekê, girîng e ku meriv di mîhengê xwe de rêbazên standard bikar bîne. Her çend gelek reagentên Naat li Enstîtuya Tenduristiya Giştî ya Etiyopî (EPHI) û li seranserê welêt jî hene, ne nirxandina hevbeş a bandora wan hîn nehatiye ragihandin. Ji ber vê yekê, ev lêkolîn armanc kir ku performansa berhevkar a kîtekên bazirganî yên bazirganî ji bo tespîtkirina Sars-cov-2 ji hêla RRT-PCR ve bi karanîna nimûneyên klînîkî bikar tîne.
Bi tevahî 164 beşdaran bi Covid-19-ê gumanbar di vê lêkolînê de bûn. Piraniya nimûneyan ji navendên dermankirinê (118/164 = 72%), dema ku 46 (28%) beşdaran ji navendên ne-dermankirinê bûn. Di nav beşdaran de ku li navendê nehatine dermankirin, 15 (9.1%) bûyerên bi klînîkî gumanbar û 31 (18.9%) têkiliyên dozên piştrast hebûn. Beşdarên neh (56%) beşdaran mêr bûn, û wateya (± SD) temenê beşdaran 31.10 (± 11.82) salan bû.
Di vê lêkolînê de, rêjeyên erênî û neyînî yên çar testên ji bo Covid-19 hatin destnîşankirin. Bi vî rengî, rêjeyên erênî yên ABBOTT SARS-COV-2, NCOV ASSAY, Sars-COV-2 BGGi ASSAY, û Sansure Biotech 2019-NCOV ASSAY 59.1%, 58.9% û 55.5 û 55.5 û 55.5 û 55.5 û 55.5 û 55.5 û 55.5 Encamên Reference Reference yên erênî û neyînî (CRS) 97 (59.1%) û 67 (40.9%), bi rêzdarî (Table 1). Di vê lêkolînê de, danasîna crs li ser bingeha "her rêzek" ya erênî, bi vî rengî ji çar encamên testê, du an zêdetir encamên testê yên ku heman encam an neyînî hatine hesibandin.
Di vê lêkolînê de, me peymanek sedî ya neyînî (NPA) ji 100% (95% CI 94.6-100) ji bo hemî analîzên li gorî crs. Analîzên Sanserî PPA-ê ya herî kêm 93.8% (95% Ci 87.2-97.1) û analîzê Daan Gene 2019-NCOV-ê ji 99.4% (95% CI 96.6-99.9). Berevajî vê, lihevhatina giştî di navbera SARS-COV-2 BGGi ASSAY û Sansure Biotech 2019-NCOV de 98.8% û 96.3%, bi rêzdarî (Table 2).
Kappa Kappa Kappa lihevhatî di navbera CRS û Encamên Serhildana SARESS-COV-2 de bi tevahî domdar (K = 1.00). Bi vî rengî, nirxên Kappa yên Cohen hatine tespîtkirin ji hêla Daan Gene-Cov-2 BGI, û Sansure Biotech 2019-NCOV bi CRS (K ≥ 0.925) jî bi tevahî pêk tê. Di vê analîzasyona berbiçav de, testa Chi-Square (testa McNemar) nîşan da ku encamên Sanserî Biyotech 2019-NCOV ji encamên CRS-ê girîng bûn (P = 0.031) (Table 2).
Wekî ku di Fig.1 Ji sedî nirxa CT-ya herî kêm (<20 ct) ya assay (RDRP û NCE-ê ya Sanserî BiyalEch 2019-NCOV) bû ku% 50.3% û nirxa CT ya bilind bû (36-40 CT). 1 Ji sedî nirxa CT-ya herî kêm (<20 ct) ya assay (RDRP û NCE-ê ya Sanserî BiyalEch 2019-NCOV) bû ku% 50.3% û nirxa CT ya bilind bû (36-40 CT).Wekî ku di Fig.1, Проценьшего значения Ct (<20 ct) анализа Abbott sarars-cov-2 (комбинированный ген RDRP и n) гнавивие Показло что зоцент низкого значения Ct (<20 ct) Составлял 50,3%, а высокое значение значение (36-40 ct) составляло 3,2%. 1, ji sedî ya nirxa CT ya herî nizm (<20 ct) ya abbott sar-coV-2 (46%) 3,2%.如图 1 所示, Abbott Sars-COV-2 检测 (结合 RDRP 和 n 基因) 的最低 CT 值百分比 (<20 ct) 检测的 检测的 (<20 ct) 的百分比为 CT 值 (36-40 CT) 的百分比为 3.2%. Wekî ku di Figure 1 de hatî destnîşan kirin, ji sedî nirxa CT-ya herî kêm (<20 ct) Testê Sansure Biotech 2019-NCOV (<20 CT) 高 50.3%, 高 CT (36-40 CT) 3,2% ye. Как показано на рисунке 1, анализ Abbott Sars-COV-2 (Сопетающий имел имое низкое процентное значение в размере Гена ORF1A / B Исследовании Sansure Biotech 2019- анализ NCOV Показал низкий Ct. Wekî ku di Figure 1 de tê nîşandan Процент значений (<20 ct) Составил 50,3%, nav ber vê yekê (36-40). Ji sedî nirxan (<20 ct)% 50.3% bû, û sedî sed nirxên CT (36-40 CT) 3,2% bû.Testa Abbott Sars-COV-2 B Nirxên CT li jor 30 tomar kir. Ji aliyekî din ve, li ser BGGi Sars-COV-2 ASSAY ORF1A / B Gene bi nirxek CT-ya bilind hebû (> 36 CT) ji sedî 4% (Fig. 1). Ji aliyekî din ve, li ser BGGi Sars-COV-2 ASSAY ORF1A / B Gene bi nirxek CT-ya bilind hebû (> 36 CT) ji sedî 4% (Fig. 1). Сдругой стороны, в анализе Bgi Sars-COV-2 Ji aliyekî din ve, di analîza BGGi Sars-COV-2 ORF1A / B nirxek CT-ya bilind hebû (> 36 CT), sedî sedî ya ku 4% (Fig. 1) bû.另一方面, 在 BGI sars-cov-2 检测中, Orf1a / B 基因具有高 CT 值 (> 36 CT) 的百分比为 4% (图 1). Ji aliyekî din ve, li Dîtina BGGi Sars-COV-2, ji sedî sedî ya Orf1a / B Gene / B Gene / bi nirxa CT-ya bilind (> 36 ct)% 4 e (Figure 1). Сдругой стороны, в анализе Bgi sars-cov-2 процент генов процент генов процент генов провокими Ji aliyekî din ve, di analîzên BGGi Sars-2, ji sedî sedî ya Orf1a / B Genes bi nirxên ct bilind (> 36 ct) 4% (Fig. 1).
Di vê lêkolînê de, me 164 nimûneyên nasopharyal pêk anîn. Ji bo her cûre assayan, tecrîdkirina RNA û amplification bi karanîna rêbaz û kîtekên ku ji hêla hilberînerên têkildar ve têne pêşniyar kirin hate kirin.
Vê lêkolînê nîşan da ku ceribandina Abbott ji bo Sars-COV-2 xwedî performansa heman tespîtkirinê ye, bi 100% erênî, neyînî, neyînî û bi tevahî. Peymana Kappa Cohen 1.00 e, ku peymana tevahî bi CRS re nîşan dide. Lêkolînek wiha ya ji hêla Zanîngeha Washingtonê ve dît ku hest û hişmendiya tevahî ya testa abbott ji bo Sars-COV-2 bû 93% û 100%, li gorî CDC-ê ya Laboratoriyê (LDA) ya CDC. 11 Lêkolînek li Viyana, Avusturya jî nîşan da ku volume nimûneyên mezin û tespîtkirinên berbiçav ji bandorên dilxweşî û zêdebûna karbidestiya tespîtkirinê zêde kirin13. Bi vî rengî, maça bêkêmasî ya Abbott ji bo Saziyên Sars-COV-2 dikare bi hevdemî re têkildar be ku bi hevdemî bi hevdemî tespît dike, hejmareke mezin ji nimûneyan (40 ml) derxîne (40 μl).
Encamên me her wiha nîşan dan ku performansa tespîtkirinê ya testa genetîkî ya DAAN hema hema wekî crs-ê bû. Ev bi xwendinê re li zanîngeha Anhui ya li Huainan, Chinaîn, û doza hilberînerê 100% peymana erênî pêk tê. Tevî raporên encamên domdar, yek nimûne piştî çareserkirina eynîbûnê neyînî bû, lê li Abbott Sars-cov-2 û Sansure Biotech ncov-2019 Assays. Ev pêşniyar dike ku dibe ku di encaman de li seranserê cûrbecûr cûrbecûr cûrbecûr cûrbecûr hebe. Dîsa jî, di lêkolîna li Chinaînê de hate meşandin, encama DAAN ya Gene Gene bi girîngî cûda bû (P <0.05) li gorî Assaya Referenceya Tabî ya Kêmkirî. Dîsa jî, di lêkolîna li Chinaînê de hate meşandin, encama DAAN ya Gene Gene bi girîngî cûda bû (P <0.05) li gorî Assaya Referenceya Tabî ya Kêmkirî. Тее менее, в исследовании, проведенном вкитае15, Анализа Daan Gene значительно отличался (P <0,05) analîzas. Lêbelê, di lêkolînek li Chinaînê de, encama analîzên Gene Gene bi girîngî cûda bû (P <0,05) ji analîzên referansa wan ya kedê.然而, 在中国进行的研究中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异 (p <0.05).然而, 在中国进行的研究中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差 <0.05 Оснако ви кистледовании, проветенном вишти тесеского значительно значительно отличались (P <0,05) по сравнению сталонным Лаборорным тестом. Lêbelê, di lêkolînek li Chinaînê de, encamên testa genetîkî ya DAAN-ê bi girîngî cûda bûn (p <0.05) li gorî ceribandina kedê ya referansa xwe.Dibe ku ev cûdahî ji ber ceribandina referansê ji bo tespîtkirina Sars-COV-2 be, û dibe ku lêkolînên din jî girîng e ku sedem diyar bikin.
Wekî din, lêkolîna me performansa berhevkar a SARS-COV-2 BGGi CRS nirxand, peymana sedî ya erênî (PPA = 97.9%), peymana sedî ya neyînî (NPA = 100%), û peymana sedî ji hêla zayendî ve ji hêla zayendî ve. ). = 98.8%). Nirxên Kappa Cohen peymanek baş nîşan dan (K = 0.975). Lêkolînên li Hollanda16 û Chinaîn encamên domdar destnîşan kirin. Testa Sars-COV-2 BGi yek genim yek e (Orf1a / B) Bikaranîna Deteksiyonê 10 μL amplification / Detection CLEATE. Tevî peymana statîstîkî ya baş bi encamên me yên referansa, analîzê du nimûneyên erênî (1.22%) ji nimûneya tevahî winda kir. Ev dikare ji bo danasîna dînamîkan hem jî di asta nexweş û civakê de encamên klînîkî yên mezin hene.
Analîzek din a berhevkirî di vê lêkolînê de sansure biotech ncov-2019 RRT-PCR (RUO) ASSAY bû; Ji sedî maça giştî 96.3% bû. Hêza peymanê jî ji hêla nirxa Kappa ya Kappa, ku 0.925 bû, ku bi CRS-ê re peymanek tevahî nîşan dide. Carek din, encamên me yên lêkolînên ku li Zanîngeha Başûrê Navîn li Changsha, Chinaîn, û li Beşa Laboratoriya Klînîkî ya Nexweşxaneya Gelê ya Lîzhou, Chauzhou, Chain171711117. Her çend lihevhatina statîstîkî ya jorîn jî hate tomarkirin Her çend lihevhatina statîstîkî ya jorîn jî hate tomarkirin Несмотря на но, тото было зафиксировано зафиксировано зорошее Статистическое что результат анализа Sansure biotech Имеет статистически значимое различие по сравнению С CRS (0 0,005). Her çend rêkeftina statîstîkî ya baş hate tomarkirin, testa Chi-Square (testê McNemar) nîşan da ku encama sanserîetê Assay cudahiyek statîstîkî ya girîng li gorî crs (0. 0.005) bû.尽管记录了上述良好的统计一致性, 但卡方检验 (macnemar 检验) 表明, Sansure Biotech 检测的结果与 crs 相比具有统计学显着差异 (p <0.005).尽管 记录 了 上述 良好 统计 统计, 但 检验, 但 检验 ,,, Macnemar 检验 表明 ,, Sansure Biotech 检测检测结果 crs 相比 具有 显着 ((P <0.005 ...................)))) Несмотря на отмеченное отмеченное статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий макнемара) разницу (p <0,005) между анализом Sansure biotech И crs. Tevî peymana statîstîkî ya baş, testa Chi-Square (testa McNemar) cûdahiyek statîstîkî ya girîng (p <0.005) di navbera Sansure Botach Assay û CRS de nîşan da.Şeş nimûneyên (3.66%) hatin dîtin ku negatîfên derewîn li gorî crs (Tabloya Supplementle 1) hatine dîtin; Ev pir girîng e, nemaze dînamîkên veguhastina vîrusê. Daneyên jorîn jî vê rêjeya deteksiyonê ya kêm piştgirî dike.
Di vê lêkolînê de, nirxên CT ji bo her platforma her tiştî û rêzgirtinê, bi nirxa herî kêm a CT re hat destnîşankirin, ku di Assay of Abbott Sars-Cov-2 de hate ragihandin. Dibe ku ev encam bi Sîstema Testkirina Genetîkî ya Abbott re têkildar be ji bo tespîtkirina Sars-Cov-2. Ji ber vê yekê, li gorî Figure 1, 87.6% ji Encamên CT-COV-2 yên Abbott SARS-COV-2 li jêr 20 heb hejmarek piçûk (12.4%) di rêza 20-30 de bûn. Nirxên CT li jor 30 nehat tomarkirin. Digel forma testê ya SARBott ya SARBott-ê, dibe ku ev encam bi sînorê tespîteya jêrîn (32.5 RNA kopî / ml) 18, ku sê caran kêmtir e ji 100 RNA kopî / ml. ml) 19.
Vê lêkolînê hin sînorkirin hene: Yekem, rêbazên me yên standard / referansê [wekî barê viral an ceribandinên laboratîf (LDA)] ji ber nebûna çavkaniyan tune. Ya duyemîn jî, hemî nimûneyên ku di vê lêkolînê de têne bikar anîn, swabsên nasopharyngeal bûn, di heman demê de encamên ji celebên din ên nimûneyê, û sêyemîn jî ne pêkan bûn, mezinahiya meya piçûk piçûk bû.
Vê lêkolînê ji bo SARS-COV-2 SARS-COV-2 bi karanîna nimûneyên nasopharyngeal pêk tê. Hemû Tezmînata Detection performansa nêzîkî hevbeş hebû, bi xêra Sansure Botach Assay. Wekî din, rêjeya pozîsyona kêm di Sansure Biyotech de ligel CRS (P <0.05) hate destnîşankirin. Wekî din, rêjeya pozîsyona kêm di Sansure Biyotech de ligel CRS (P <0.05) hate destnîşankirin. Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных резильтотов по сравнению с crs (0,05). Wekî din, testa biyotech sansure ji sedî kêm a encamên erênî li gorî crs (P <0.05) nîşan da., 与 crs 相比, Sansure biotech 检测的阳性率较低 (p <0.05)., 与 crs 相比, Sansure biotech 检测的阳性率较低 (p <0.05). Кроме Того, анализ Sansure biotech Имел более низкий уровень положительных резильтов по сравнению с Crs (0 0,05). Wekî din, Sansure Biyotech Assay xwedî rêjeyek pozîsyona kêmtir li gorî crs (p <0.05).Sansure Biotech NCOV-2019 (RUO) analîzkirina PPA, peymana giştî ji 93,5% bi hêza Kappa ya Cohen ji nirxa peymana 0.925 derbas bû. Di dawiyê de, Sansure Biyotech Assay (RUO) hewcedariya karanîna li Etiyopyayê, û lêkolîna zêde divê were hesibandin ku îdîayên ji hilberînerên kesane binirxînin.
Sêwirana Lêkolîna Berhevkar li çar saziyên tenduristî yên li Addis Ababa, eka Kotebe, Navenda Dermanê Millenium, Nexweşxaneya Memê ya Zewooditu, û Nexweşxaneya Pise ya TUBERCULASIS-a St. Peter. Daneyên di navbera 1 û 31 Decemberile 2020-an de hatin komkirin. Dezgehên bijîşkî ji bo vê lêkolînê li ser bingeha hejmarên wan ên giran û hebûna navendên dermankirina mezin li bajêr hatin hilbijartin. Bi vî rengî, amûrên, tevî alavên PCR-ê ya rastîn, li gorî pêşniyarên hilberînerên Naat re hatin hilbijartin, û çar kîtekên tespîtkirina PCR ji bo vê lêkolînê hatin hilbijartin, ku piraniya laboratîfên li Etiyopyayê herî kêm çar ji wan bikar anîn. Testa Gene, Test Test Test Test, Sansure Biotech, Sars-Cov-2 BGi Testê ku di dema xwendinê de hate kirin).
Testkirina ji bo Sars-COV-2 ji 1 heta 30 Kanûn 2020 bi karanîna 3 ml ji navgîniya Viral Viral (VTM) Nimûneyên nasopharyehgê ji hêla berhevkerên nimûneyên perwerdekirî ve hatin komkirin û şandine EPHE di pakêtên sêalî de. Berî tecrîdkirina acîdê ya nukleîk, her nimûneyek hejmarek nasnameya yekta tête diyar kirin. Extraction ji her nimûneyê di cih de piştî gihîştina rêbazên xwerû û otomatîk û otomatîk tê bikar anîn. Bi vî rengî, ji bo derxistina otomatîk a Abbott M2000, 1.3 ml (0.8 ML) ) Batchek 96 [92 nimûneyên kontrolê û du kontrolên ne-şablonê (NTC)] di pêvajoya giştî de (vekişandin û tespîtkirin) du rêzên Sars-COV-2 (EUA) di wextê rastîn de pêk hat. zemî. Bi vî rengî, ji bo derxistina manual, heman nimûneyan bikar bînin (ji bo derxistina otomatîk û kifşkirinê). Bi vî rengî, li seranserê pêvajoyê, 140 μL bi karanîna qiaamp viral rna mini kit (Qiagen Gmbh, Hilden, Germania) Bikaranîna elsualsandî ya bi destan bi karanîna Abi 7500 Cycler bi karanîna Sars-COV-2 BGi Assay, Daan Gene Assay, û Sansure Biotech Assay.
Dezgeha otomatîk û paqijkirina Sars-COV-2 Viral RNA li dû prensîba magnetîkî ya Bead-ê bi karanîna Reagentên Amadekirina Abbott DNA. Nîşankirin û solubilîzasyona parçeyên virusê tête bikar anîn ku bi karanîna gerîdokî ya guanidine isothiocyanate ji bo înkarkirina proteîn û rnase ya neçareseriyê înkar dike. Hingê RNA ji proteîna qonaxa zexmî ji hêla SILICA ve hatî veqetandin, ango guanidinium xwê û alkaline pH ya buffer ya lîzê ji silica (sio2) re pêşve dike. Pêla rûkenan proteîn û dek û dolabên mayî rakirin da ku çareseriyek zelal hilberîne. RNA zelal ji mîkrobên SILICHTICLES-ê bi karanîna zeviya magnetîkî ya amûreyê20,21 e. Ji hêla din ve, tecrûbeya manual û paqijkirina RNA ji hêla rêbaza kolonê ya spîn ve tête bikar anîn ku li şûna centrifugasyona li şûna standek magrojîtîk û veqetandina mîkrozmê ji zalimê.
Testê tespîtkirina SARBOTT-ê ya SARBOTT (Abbott Molekular, Inc.) li gorî rêwerzên hilberîner, yên ku EUA19,22 ji Kê û Fda wergirtibû hate kirin. Di vê protokolê de, nimûneya nimûneyê berî ku derxistina di nav rûnê avê de li 56 ° C ji bo 30 min. Piştî vîrûsa vîrusê, derxistina acîdê nukleîk li ser amûrek SP-ya abbott m2000-ê ji 0.5 ml vtm bi karanîna pergala amadekirina Sambott M2000 DNA-ê hate pêkanîn. li gorî hilberîner. Amûlkirin û tespîtkirin bi karanîna instrumentalek RT-PCR ya Abbott M2000 RT-PCR hate kirin, û tespîta dualî ji bo rdrp û n Genes hate kirin. ROX) û Vic P (vîna xwedan) ji bo armanc û tespîtkirina kontrolên navxweyî, destûrê dide ku tespîtkirina hevdemî ya her du hilberên amplification 19.
Rêbaza tespîtkirina amplification ya vê kîteyê li ser teknolojiya yek-gav RT-PCR-ê ye. ORF1A / B NO N G GENES JI BO Herêmên Refirî ji hêla Teknolojiya DAAN Gene ve hatî hilbijartin da ku amplificationerciationalakkirina herêma Armancê tespît bikin. Pêşniyarên taybetî û Pirsgirêkên Fluorescent (n Pirsgirêkên Gene bi Fam, Orf1a / B Probes Bi Vic) hatine nîşankirin ji bo tespîtkirina sars-cov-2 RNA di nimûneyan de hatine çêkirin. Mixesên dawîn û masterê yên masterê bi zêdekirina 5 μl ya ji 20 μl ya masterê ya masterê heya 25 μl. Amûlbûn û tespîtkirin bi hevdemî li ser Abi 750024-ê ya rastîn a PCR-ê hate pêkanîn.
Orf1a / B û N Genes bi karanîna Sansure Biotech NCOV-2019 Kitêba Nucleîk a Nucleic (tespîtkirina PCR Fluorescent) hatin tespît kirin. Ji bo her genimê hedef ji bo Navnîşa FAM-ê ji bo Navbera Orf1a / B Region û Kanala ROX-ê ji bo N Gene-yê hilbijêrin. Ji bo vê kîtekîtê assay, reagentên elemayî û master-ê wekî jêrîn têne zêdekirin: Prepare 30 μL Master Mix Reagent û 20 μL ji bo tespîtkirin / amplification. Real-time PCR ABI 750025 ji bo amplification / tespîtkirin hate bikar anîn.
Testa SARS-COV-2 BGI-ya RRT-PCR ya RRT-PCR-ê ji bo tespîtkirina Covid-19 e. Herêma armancê li herêma Orf1a / B ya Genoma Sars-COV-2, ku rêbazek tespîtkirina gener e. Wekî din, genê xaniyê mirovî β-actin genimek armancê navxweyî ye. Master mix bi tevlihevkirina 20 μl ya Master Mix Reagent û 10 μL ya RNA ya RNAkirî ya li Plate26-ê baş e. An Abi 7500 Fluorescent Quantitical PCR ji bo amplification û tespîtkirinê hate bikar anîn. Hemî amplification acîdê Nekolî, şertên Run PCR ji bo her tasînê, û şîrovekirina encaman li gorî rêwerzên hilberîner ên têkildar (Table 3) hate kirin.
Di vê analîzên berbiçav de, me rêbaza standard a referansê bikar ne anî ji bo destnîşankirina sedî (erênî, neyînî, neyînî) û parameterên din ên berhevkar ên ji bo çar analîzên. Her berhevoka testê bi CRS re hate kirin, di vê lêkolînê de ji hêla rêziknameyê ve hatibû destnîşankirin "her erênî" û encam nehatiye destnîşankirin, ne ji hêla yek ceribandinek, me bi kêmî ve du encamên testa hevbeş bikar anîn. Wekî din, di doza veguheztina Covid-19 de, encamên neyînî yên derewîn ji encamên erênî yên derewîn xeternak in. Ji ber vê yekê, ku ji encamek crsê re rast "erênî" bibêjin, divê herî kêm du testên assayan erênî bin, tê vê wateyê ku bi kêmanî yek encamek erênî ji bo Assayek EUA tê. Bi vî rengî, ji çar encamên testê, du an zêdetir encamên testê yên ku di heman encam de didin erênî an neyînî li ser erênî têne hesibandin.
Daneyên bi karanîna formên derxistina daneyên çêkirî hatine berhev kirin, têket û analîzên daneyê bi karanîna guhertoya statîstîk a Excel û SPSS-ê ji bo statîstîkên despêkê hatin bikar anîn. Erênî, neyînî, û lihevkirina sedî ya giştî hate analîz kirin, û encamek Kappa ji bo destnîşankirina asta peymana her rêbazê bi crs re hate bikar anîn. Nirxên Kappa wekî jêrîn têne şîrove kirin: 0.01 ji 0.20 ji bo peymana gelemperî, 0.21 ji 0.40 ji bo peymana gelemperî, 0.61-0.80 ji bo peymana mezin û 0.81-0.99 ji bo peymana bêkêmasî28.
Paqijiya exlaqî ji Zanîngeha Addis Ababa û hemî protokolên ezmûnî ji bo vê lêkolînê ji hêla Enstîtuya Tenduristiyê ya Etiyopî ya Enstîtuya Etiyopî ve hat pejirandin. Hejmara referansê ya ji bo lîsansa ephics EPHI / IRB-279-2020 e. Hemî rêbaz li gorî pêşniyar û bendên rêbernameyên Neteweyî yên Neteweyî yên Etiyopî ji bo dermankirina CovîD-19 hate pêkanîn. Wekî din, razîbûna agahdar a nivîskî ji hemî beşdaran xwendinê beriya beşdarbûna xwendinê hate wergirtin.
Hemî daneyên ku di vê lêkolînê de hatine wergirtin an analîz kirin di vê gotara weşandî de tê de hene. Daneyên piştgiriya encamên vê lêkolînê ji nivîskarê têkildar re li ser daxwazek maqûl peyda dibin.
Rêxistina Tenduristiya Cîhanê. Pêşniyarên ji bo stratejiyên ceribandina laboratîf ji bo Covid-19: Rêbernameya Navîn, 21ê Adarê, 2020 Nû WHO / 2019-NCOV / Lab_Testing / 2020.1 (Kî, 2020).
Mouliou, Ds, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki Covid-19 Diagoliya Smart Di Dezgeha Rewşa Awarte de: Hemî-di pratîkê de. Mouliou, Ds, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki Covid-19 Diagoliya Smart Di Dezgeha Rewşa Awarte de: Hemî-di pratîkê de.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. and Gurgulianis, KI Diagnostasyona hişmend a Covid-19 di beşa lezgîn de: Her tişt di pratîkê de.Muliou DS, Pantazoposos I. and Gurgulyanis ki tespîtkirina hişmend a Covid-19 di beşên awarte de: Yekbûna dawiya dawîn di pratîkê de. Pispor Reverend respire. derman. 3, 263-272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Nirxandina Covid19 ID niha Eua Assay. Mitchell, SL & St George, K. Nirxandina Covid19 ID niha Eua Assay.Mitchell, SL û St. GEORGE, K. Nirxandina COVID19 ID Now Now Eua Assay.Mitchell SL û St. George K. Nirxandina Covid19 ID Now Now Eua Assay. J. Klinical. Vîrus. 128, 104429. Https://doi.org/10.1016/J.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. Dîtina laborating ya nexweşiya Coronavirus 2019 (Covid-19) di nexweşiya mirovî gumanbar de. https://www.who.int/Publications/i/item/10665-331501 (gihîştî 15 Tebax 2020) (Kî, 2020).
Udugama, B. et al. Covid-19 Diagnosis: Nexweş û amûrên ceribandinê. ACS Nano 14 (4), 3822-3835 (2020).
Syed S. Et Al. Damezrandina Koleja Pathologs of Afrîka Rojhilat, navendî û başûr - Dibistana Herêmî ya Patholojiya Rojhilata Navîn û Afrîka Başûr. Efrîka. J. Lab. derman. 9 (1), 1-8 (2020).
Enstîtuya Tenduristiya Giştî ya Etiyopî, Wezareta Tenduristiya Federal. Stratejiya Neteweyî ya Neteweyî û Rêbernameya Neteweyî ya ji bo tespîtkirina laboratorê Covid-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/ephi_pheoc_covid-19_laborister_diagnosis_eng.pdf (gihîştina 12 Tebax 2020) (EPHI, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, wekî ceribandinên neyînî yên derewîn ji bo pirsgirêk û encamên enfeksiyonê yên SARS-COV-2. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, wekî ceribandinên neyînî yên derewîn ji bo pirsgirêk û encamên enfeksiyonê yên SARS-COV-2.Voloshin S., Patel N. û Kesselheim wekî ceribandinên derewîn-neyînî ji bo enfeksiyonên SARS-COV-2 û encamên wan.Voloshin S., Patel N. û Kesselheim wekî ceribandinên derewîn-neyînî ji bo provakasyonê û bandora enfeksiyonê ya Sars-COV-2. N. ENG. J. Derman. 383 (6), E38 (2020).
Mouliou, Ds & Gourgoulianis, Ki FalsGoulianis, Ki False-erênî û derewîn CoviD-19 Covi negatîf: Stratejiyên pêşîlêgirtin û rêvebirinê, vakslêdan, û perspektîfên din. Mouliou, Ds & Gourgoulianis, Ki FalsGoulianis, Ki False-erênî û derewîn CoviD-19 Covi negatîf: Stratejiyên pêşîlêgirtin û rêvebirinê, vakslêdan, û perspektîfên din. Moulioou, Ds & gourgoulianis, Ki Ложноположительные и ложноотрательные случаи Covid-19: Респираторная профилактика и сакцинация и дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, ki FALSE erênî erênî û derewên neyînî yên Covid-19: Stratejiyên pêşîlêgirtin û dermankirinê, vakslêdan û awayê pêş.Muliu, Ds û Gurgulianis, ki derewîn-erênî-erênî û derewîn ên Covid-19: Stratejiyên ji bo pêşîlêgirtin û dermankirina respirasyon, vakslêdanê û awayê pêş. Pispor Reverend respire. derman. 15 (8), 993-1002 (2021).
Mouliouou, Ds, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Covid-19 Diagnosti di beşa lezgîn de: Dara dara lêdana daristanê winda dike. Mouliouou, Ds, Ioannis, P. & Konstantinos, G. Covid-19 Diagnosti di beşa lezgîn de: Dara dara lêdana daristanê winda dike.Mouliou, DS, Ioannis, P. û Konstantinos, G. Covid-19 tespîta di beşa lezgîn de: Dara bibînin, daristan winda bikin.Muliou Ds, Ioannis P., û Konstantinos G. Covid-19 tespîtkirina di odeyên acîl de: ji bo daran daristanek ne bes e. Xûyabûn. derman. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-angeli, e. et al. Ragihandin û erêkirina performansa analîtîkî û klînîkî ya ji bo Abbott Realtime Sars-COV-2 assay. J. Klinical. Vîrus. 129, 104474. Https://doi.org/10.1016/J.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, Hr, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflalipon, B. Berhevdan Ji hêla Vediation of VeViVeation RT-PCR ve ji hêla enfeksiyonê ya vîrus. Mollaei, Hr, Afshar, Aa, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflalipon, B. Berhevdan ji pênc Primter ji herêmên cuda yên CovîD-19 ji hêla Vegera Virus ve ji hêla RT-PCR ve.Mollaei, Hr, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. and Aflatunyan, B. Berhevdana pênc komên destpêkê ji herêmên cûda yên Covid-19 ji bo tespîtkirina enfeksiyonê ya Vîret ji hêla RT-PCR. Mollaei, Hr, Afshar, Aa, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflalias, B. 比较来自 Covid-19 不同基因组区域的五个引物组, 用于通过常规 RT-Pcr. Mollaei, Hr, Afshar, Aa, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflalipon, B. Berhevdana 5 herêmên cuda yên genetîkî yên Covid-19 ji bo tespîtkirina enfeksiyonê ya vîretî ji hêla RT-PCR.Mollaei hr, Afshar Aa, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. and Aflatunyan B. Berhevdana pênc komên destpêkê ji herêmên cûda yên Covid-19 ji bo tespîtkirina enfeksiyonê ya vîrî ji hêla RT-PCR.Iran. J. Microbiology. 12 (3), 185 (2020).
Goertzer, I. et al. Encamên pêşîn ên bernameya nirxandina neteweyî ya derveyî ya ji bo tespîtkirina rêzikên SARS-COV-2 SEQUENCS. J. Klinical. Vîrus. 129, 104537. Https://doi.org/10.1016/J.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, M. et al. Nirxandina analîtîkî ya bandoriya pênc RT-PCR ji bo sindromasyona tîrêjê ya giran Coronavirus 2. J. Klinical. lêkolînxane. qûn. 35 (1), E23643 (2021).
Wang B. Et Al. Nirxandina heft karsaziyên SARS-COV-2 RNA li ser bingeha reaksiyona zincîra polîmerase ya rastîn (PCR). nexweşxaneyî. Şîmyakî. lêkolînxane. derman. 58 (9), E149-E153 (2020).
Van Casteren, Pb et al. Berhevdana heft kîtekên tespîta Covîdê ya RT-PCR Commid-19. J. Klinical. Vîrus. 128, 104412 (2020).
LU, YU, ET AL. Berhevdana performansa tespîtkirinê ya du kîtên PCR ji bo tespîtkirina acîdên nukleîk ên Sars-COV-2. J. Klinical. lêkolînxane. qûn. 34 (10), E23554 (2020).
Lefart, ER, hwd, lêkolînek tevlîhevî ya çar SARS-COLL COMP-2 ACBETA SARS-COV-2 SARS-COV-2 nîşan da ku ID Naha performansa bi celeb û celebê nimûneyê ve girêdayî ye. teşhîs. Microbiology. Derbaskirin. belav. 99 (1), 115200 (2021).
Abbott Molekul. Abbott Real-Time Sars-Cov-2 Analysis Package Insert. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/realtime-sar-cov-2-assay. 1-12. (Ji 10-ê Tebaxê, 2020) (2020).
Klein, S. et al. Sars-cov-2 rna isolation ji bo tespîtkirina RT-QPCR û RT-Lamp. Virus 12 (8), 863 (2020).